CPANモジュールを活用
CPAN（Perlのパッケージリポジトリ）には豊富なモジュールがあります。Bioinformatics・DBI（データベース）・LWP（HTTP）などが有名です。

バイオインフォマティクスへ
BioPerl（bioperl.org）を使うとゲノム・タンパク質データの処理が書けます。生命科学系の研究機関では今でも現役です。